Yusuf Emre Akgündüz 1987 yılında İstanbul’da doğmuştur. 2009 yılında Utrecht Üniversitesi Ekonomi Bölümü’nden mezun olmuş ve aynı üniversitede 2014 yılında ekonomi alanında doktorasını tamamlamıştır. Doktorasını tamamladıktan sonra Hollanda Merkez Planlama Bürosunda ekonomist olarak çalışmıştır. Aynı dönemde Utrecht Üniversitesi’nde Avrupa Birliği projeleri kapsamında doktora sonrası araştırmalar yürütmüştür. 2016 yılında Türkiye’ye dönerek Türkiye Cumhuriyet Merkez Bankası’nda ekonomist olarak göreve başlamıştır. 2019 yılında ise Sabancı Üniversitesi Sanat ve Sosyal Bilimler Fakültesi ekonomi grubuna önce misafir, ardından kadrolu öğretim üyesi olarak katılmıştır. 2022 yılının sonlarında Türkiye Cumhuriyet Merkez Bankası’na baş danışman olarak dönmüştür. Şubat 2024’te Yatırımcı İlişkileri ve Uluslararası Kuruluşlar Genel Müdürü, Haziran 2024’te Bankacılık ve Finansal Kuruluşlar Genel Müdürü ve 9 Mayıs 2026 tarihinde ise Türkiye Cumhuriyet Merkez Bankası Başkan Yardımcılığı’na atanmıştır.